El siguiente comunicado de prensa fue emitido hoy por el Broad Institute of MIT y Harvard.

Los científicos utilizan rutinariamente pantallas genéticas para perturbar o cambiar la actividad de genes en células de mamíferos, uno a la vez, para aprender qué hacen esos genes. Las pantallas agrupadas adoptan este mismo enfoque, pero generalmente involucran muchas más perturbaciones genéticas en todo el genoma. Sin embargo, con las pantallas agrupadas, los científicos solo pudieron rastrear la supervivencia celular y otras mediciones simples de células enteras.

La microscopía es una herramienta importante que permite a los biólogos medir simultáneamente muchas características celulares con alta resolución. Los investigadores han tratado de combinar las pantallas genéticas con la microscopía para estudiar los efectos de los genes en una amplia gama de comportamientos celulares, pero hacer esto de un gen a la vez ha sido costoso y requiere mucho tiempo.

Ahora, investigadores del Instituto Broad del MIT y Harvard y del MIT han desarrollado un nuevo método que combina pantallas genéticas agrupadas a gran escala con análisis basados ​​en imágenes del comportamiento celular. El enfoque, llamado pantallas combinadas ópticas, permite a los investigadores examinar cómo los genes afectan los procesos celulares complejos con resolución espacial y temporal, de formas que otras pantallas combinadas no podrían.

“Con este nuevo enfoque, cualquiera puede usar la microscopía para examinar miles de genes en unos pocos días sin equipo especializado”, dijo Avtar Singh, posdoctorado en el laboratorio de Pablo Blainey en el Amplio.

El estudio, publicado en Celular, fue dirigido por el autor principal Blainey, miembro central del instituto Broad y profesor asociado en el Departamento de Ingeniería Biológica del MIT. Singh fue coautor junto con David Feldman, quien anteriormente fue estudiante de doctorado en física en los laboratorios de Feng Zhang y Blainey.

Los autores examinaron los efectos de 952 genes en la actividad de señalización de un complejo de regulación inmunitaria llamado NF-kB al obtener imágenes de la ubicación celular de una proteína llamada p65 en millones de células. Descubrieron un nuevo papel para dos genes, MED12 y MED24, en la relajación de la señalización de NFkB.

“Mirar a través de un microscopio a las células vivas te permite ver cómo los genes influyen en los procesos biológicos en el espacio y el tiempo, algo que no podrías capturar fácilmente con otros métodos”, dijo Feldman.